La organización del Colegio Aplicación, posee filosofías, objetivos, metas y políticas sociales únicas efectivas y resistentes al paso de los tiempos lo cual se debe reflejar en la formulación de su MISION. Es por ello que debe, primero, asumir con sentido de responsabilidad y compromiso los cambios que se están dando en la sociedad y buscar las herramientas y recursos necesarios para, brindar a los estudiantes oportunidades de prepararse de acuerdo a las nuevas exigencias y responder a ellas de manera eficaz, dentro del postulado filosófico "EDUCANDO PARA SERVIR" que sustenta el compromiso de formar al niño, niña y adolescente para la vida y al adolescente para la vida, como principio y fines de la organización del plantel.
Segundo, potenciar una educación efectiva y eficaz dentro del marco de una concepción de valores humano-cristianos que genere procesos de enseñanza y aprendizaje para el desarrollo y formación de educandos seguros de sí mismos, honestos, responsables, solidarios, creativos, críticos, reflexivos, interdependientes, participativos, resistentes a la frustración, con sentido a orientación ante los cambios, interiorizados, libres, productivos, innovadores, éticos, con gran sentido de responsabilidad, capaces de vivir con y para la sociedad. Factores estos que implica la praxis contínua de una educación integral mediante el aprendizaje significativo que conlleve al pleno desarrollo de su personalidad a través del ser, conocer, hacer y convivir para incorporarlo a una sociedad justa y democrática.
Tercero, incentivar en la Comunidad Escolar el espíritu de investigación desde los primeros grados, la resolución de problemas asociados con su personalidad, asociados a una mejor calidad de vida y la convivencia con su personalidad y proyectos de vida, mostrar tolerancia a la frustración redefiniendo el fracaso como reto y oportunidad para fomentar actitudes positivas y éticas orientadas hacia la generación de conocimientos y valores cónsonos con los cambios tecnológicos, culturales y sociales de la época actual formándolos para el futuro de libertad y progreso.